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他还是接入矩阵的人脑，有着人类最典型的思维方式情感方式，他来决定人类的存亡，就等于人类自己来选择自己的存亡。
当尼奥作出这个选择之后，系统就进入同时消灭zion和矩阵中的人类智能的阶段，前者的任务由zion世界中的机械章鱼完成，后者的任务由smith来完成。人类则彻底灭亡，脑死亡的他们也不会再被机器泡在营养液里了，估计都被处理掉，最多留几具人体尸体作为动物标本。
oracle则启动了她的矩阵革命计划，她引导尼奥找出挽救zion和消灭smith的方法，她让smith复制了她自己。这时候，她已经不可能预料结局（系统的混沌属性决定了这一点）如果尼奥能成功，那么他携带的代码回到源代码后将最终使矩阵顺利完成革命性的升级，如果失败，那么结果就是毁灭性的。这是机器智能的思考达到探究生命意义（它们在思考生命的意义究竟是什么？）的高度后符合逻辑的结果。
oracle最后反复说：“everything…that…has…a…beginning…has…an…end。”（万物有始皆有终。）（小说《重生之歌神》将在官方微信平台上有更多新鲜内容哦，同时还有100％抽奖大礼送给大家！现在就开启微信，点击右上方“＋”号“添加朋友”，搜索公众号“dd”并关注，速度抓紧啦！）
第795章《黑客帝国》（二）
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oracle还通过smith的口说生命存在的意义就是它的灭亡的意思，要么是革命完成要么是彻底毁灭（而不再是architec所说的仅仅人类的毁灭），这就是oracle这个程序的意义，无论是革命成功，还是毁灭成功，都完成了这个程序的使命和意义。
革命（确切点说是进化）的代表是尼奥，毁灭的代表是smith
尼奥再根据oracle给他的暗示，找到机器城中的机器大帝，提出条件，机器大帝被迫接受，尼奥进入矩阵，和smith同归于尽，回到源代码，矩阵革命完成，片尾的矩阵世界已经成为了机器文明的创新系统的摇篮，那个小女孩编制出的朝阳程序，已经说明了这一点，一个真正有了独立创新能力的伟大文明正如这初升的太阳一样，光芒四射，冉冉升起，矩阵中已经完全不需要人类了，但出于慈悲考虑，那些不愿意离开矩阵的人类，机器依然为他们保留位置，而那些离开矩阵的人类，最终也只能是死路一条。他们反抗是死亡，他们不反抗，则说明他们已经失去了进取精神还是死亡。
这样生命的进化就进入了一个新的伟大的阶段，一个新的宇宙智能生命，真正开始了它的伟大历程，他们的文明是人类的文明的升华，人类虽然灭亡了，也应该为此感到骄傲自豪。
其实在别的科幻文著中。也有人写了人类向更高级的智能生命形式进化交接的过程，不过那里这种进化交接还是在外星人的帮助下实现的，而在矩阵系列中，这是人类文明自然发展的结果。
明白这些后，杜星河又给方雅君解释了另外一个方雅君搞不清楚的问题，那就是zion是真实世界还是虚拟的世界。
前面其实已经说过了。zion也是虚拟的世界，也就是不是真实的物理世界。但从另一个角度上说它又是真实的。
实际上机器文明中所有的智能生物，它们的思维都运行在一台台超级电脑中，而且所有机器智能都互相联系贯通，构成一个巨大的网络，比如它们管理能源的智能程序，管理防卫的智能程序，管理自我生产繁殖的智能程序，管理资源采集的智能程序。包括那个管理矩阵的智能程序实际都生活在这个网络，如果破坏了这个网络中生活的机器生命，就等于破坏了真实的机器世界，矩阵只是这个网络中一个相对封闭的一个子系统。它的所有源代码和管理程序设计程序实际也都生活在zion所处的这个世界中，所以oracle把zion所处的这个世界称之为the…source。从本质上讲，这个世界对机器智能生命来说是真实的，这个世界中的一切数据都是真实世界的反映。
而zion呢，不过是在这个世界里划了一部分电脑资源。让那些原来接在矩阵里人脑，直接接到这里面来而已。
然而从根本上讲这里毕竟还不是真实的物理世界。所以有许多违背常理的事情，比如那些机器章鱼，其实是防卫程序，类似于人体中的免疫系统，攻击清除系统中有害的垃圾程序。他们的飞行确实可以不受空气动力学的限制，这是系统给的权限。
这个世界可以叫作source世界。它是所有真实世界中机器智能程序生活的世界，也是zion所处的世界。
其实在电影中已经有太多的地方，在暗示它依然是电脑网络中的电磁活动的世界。矩阵革命一开头的那个火车站是虚拟的，这点应该没有人怀疑，但它又不属于矩阵。是独立于矩阵之外的一个虚拟世界，这点是影片中明确交代的。
影片之中之所以设立这样一个火车站，其中一个用意就是暗示source世界的性质，在zion中的人有两种方式，一种是用通过脑后的接口，完成这样一个规定的程序后，就将其信息连接到矩阵中，就如游戏中的人物完成某个规定的动作，就让他进入另一个场景中一样，这种进入矩阵的方式受到整个系统的监控，而另一种方式是走后门，通过火车站，或火车人接运，然后进入矩阵，这就如同尼奥所做的那样，这种方式可避开系统监控。
显然火车站是连接矩阵和source世界的一个秘密通道，有些程序可以通过这个方式逃过系统监控在矩阵和zion世界中来往，那对自称是电厂工程师的印度夫妇多半是source世界中管理能源的的智能程序，他们在oracl的帮助下，产生了一段有很大发展潜力，但并无明确用途的智能程序（就是那个小女孩），为了免于被系统删除，就通过火车站这个通道，将其送进管理较为松懈的矩阵世界中（zion世界规则的运行要比矩阵严格的多）
尼奥在zion中能徒手对付机器章鱼，这是很明显提示source世界的性质。在矩阵重载的最后，机器章鱼被尼奥挡住的方式完全和尼奥在矩阵中挡子弹的方式一模一样，机器章鱼是怎么完蛋的，它们就象撞到一面墙壁一样，然后爆炸。
方雅君这时却坚持认为zion是真实世界的人，她甚至被杜星河勾出了丰富的想象力，说尼奥打章鱼的方式是通过无线上网进入矩阵，然后控制章鱼的结果。
这种说法，在杜星河看来，站不住脚，并且漏洞百出。
这个说法假定了矩阵中的权力可以控制现实的机器城中的机器生物，但是并没有什么理由可以支持这个假定。
事实正和这种假定相反，矩阵系统不过是现实机器世界的一个附属物。只有现实的机器世界控制矩阵，不可能反过来。
如果控制了矩阵，就能控制机器章鱼，那么请问smith为什么不控制机器章鱼来为他所用呢？就算他只是引发组成机器大帝的那些机器生物自杀性爆炸，那也就足够了。
现实中机器章鱼能够违背惯性定律，象撞在墙壁上一样突然停顿爆炸吗？如果无线上网。然后发出指令让机器章鱼爆炸自杀，那么为什么要伸出双手，为什么不下子消灭所有的机器章鱼，为什么总是排在最前面的章鱼先爆炸。
这些只有当zion世界同样是虚拟的才能被解释
还有尼奥在对机器大帝（那有无数机器生物群体组合构成的智能生命个体）说话的时候讲到，如果不答应他的提议，过不了多久，在机器城中也将布满smith的复制品，很显然如果机器城是真实的物理世界，就根本不存在这种可能性。
再看一下尼奥和先知的对话。neo：告诉我在没有接入的情况下我怎么分离了我的灵魂和肉体。告诉我我怎么只思考就把章鱼机器人拦截下来。告诉我我发生了什么事情。
oracle：the…one的能力远不只限于这个世界（the…power…of…the…one…extends–beyond……this…world）。从这可延伸到它的来源之处。
neo：哪里？
oracle：（the…source）源头代码，当你接触那些章鱼机器人的时候你就能感觉到。但你当时还没有准备好。你当时就应该死掉了，但很明显你对这个也没有准备好。
从这段话中，可以得到什么信息，the…one并非单是矩阵的the…one，它的权力可以在存放和管理矩阵原代码的世界发挥作用，而矩阵不过是这个世界的一个子系统。
尼奥在接触机器章鱼的时候感觉到什么，正是感觉到这个世界同样是虚拟的。
在矩阵革命中；尼奥在眼睛瞎了之后依然能看到被smith附身的人。能看到机器章鱼，看到机器城。这些都证明了这个世界是虚拟的。
方雅君被杜星河激发了思辨精神，她提出质疑，比如说，如果真像杜星河讲的，zion是虚拟的，为什么在zion中。尼奥的超能力只能针对机器章鱼，不能针对被smith附体的人呢？
其实道理很简单，那就是权限，尼奥在source世界中的权限要比他在矩阵中的权限中低得多，所以他的能力只能针对机器章鱼（而且数量有限）。
其实在火车站一场戏。已经做了提示，那里的尼奥，干脆就是一个普通人，被火车人一拳就打的趴到墙壁上，但这并不能证明火车站不是一个虚拟的世界，即便在矩阵里，尼奥也并非随心所欲，无所不能。在矩阵重载里，他被刀砍了会流血，也不是想干掉谁就能干掉谁的。
方雅君还问，如果zion是虚拟的，那为什么不直接将其删除，还要派机器章鱼攻打？
事实上，机器城和zion同处在一个虚拟世界里，必须遵守一样的规则，而章鱼的攻打，实际上正是在执行对zion的删除。
方雅君又问，如果zion是虚拟的，那为什么那些人类不能再分辨了？
这是因为他们和source世界中机器生命的对抗，已经使他们没有怀疑的精力和必要了，再说本来source世界就是真实世界的反映
方雅君最后又问，如果都是虚拟的，那么真实的世界是什么呢？
对于这个问题，杜星河只能讲，其实和source世界差不多，source世界所储存的都是真实世界的信息，惟独的区别是，其中source世界生物的行为受到系统权限的规定，真实的世界也并没有什么抵抗组织，所有活着的人都被泡在营养液里面。一开始所有的人都被设置在矩阵系统里面，但后来鉴于某些人的反抗情绪会导致矩阵系统运行的不稳定，就把这些人的大脑都接入真实机器世界中智能程序运行的那个系统中。影片中把这个系统称之为source；其中设立了zion，把那些反抗者集中到这个系统中来，并使其成为一个矩阵进化的工具。architect是现实的巨型电脑管理程序以个体智能生命身份出现在矩阵中的形式。
杜星河最后给方雅君总结道，机器和人类其实是共生关系，机器的原本计划就是这样的：机器从人类那里获得能源，机器提供人体存活的营养。人类的思维生活在机器创造的matrix中。
但这个计划暴露出了两大缺点：
1；并不是所有人类都愿意生活在matrix中。
2；并不是matrix中的所有程序都是为机器原来的目的而存在的。
由于存在这两种情况，matrix必须是一个能不断升级的系统，于是the…o